Los permisos menores son los trámites relacionados con la demanda uso y aprovechamiento de recursos naturales, son aquellos que requiere el proyecto obra o actividad para construir y operar, los permisos son:

1. Concesión de agua (superficial o subterránea)
2. Vertimiento (en cuerpo de agua o suelo)
3. Aprovechamiento forestal (árboles aislados, y de clase persistente o único de bosques naturales)
4. Ocupación de cauce
5. Materiales de construcción (cantera o arrastre)
6. Emisiones atmosféricas

Los permisos se tramitan ante la autoridad ambiental competente a través del diligenciamiento del formulario único nacional, en él se incluye información general del solicitante (dueño del proyecto y en consecuencia el titular de la Licencia), e información específica de carácter técnico relacionado con el recurso demandado.